Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
KCNH2Q12809 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KCNH2Q12809 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
KCNH2Q12809 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KCNH2Q12809 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KCNH2Q12809 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KCNH2Q12809 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
KCNH2Q12809 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
KCNH2Q12809 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
KCNH2Q12809 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.3 ms