Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms