Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPRMP28827 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPRMP28827 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRMP28827 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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