Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRGP23470 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms