Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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PTPRBP23467 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PTPRBP23467 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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PTPRBP23467 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PTPRBP23467 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PTPRBP23467 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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PTPRBP23467 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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