Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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USP18Q9UMW8 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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USP18Q9UMW8 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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USP18Q9UMW8 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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USP18Q9UMW8 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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USP18Q9UMW8 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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