Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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USP35Q9P2H5 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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USP35Q9P2H5 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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USP35Q9P2H5 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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USP35Q9P2H5 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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USP35Q9P2H5 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
USP35Q9P2H5 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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