Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FXNQ16595 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FXNQ16595 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms