Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms