Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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HMGN3Q15651 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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HMGN3Q15651 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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