Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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COL4A6Q14031 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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COL4A6Q14031 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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COL4A6Q14031 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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COL4A6Q14031 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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COL4A6Q14031 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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COL4A6Q14031 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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COL4A6Q14031 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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COL4A6Q14031 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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