Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms