Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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