Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SRSF5Q13243 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms