Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NME3Q13232 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.5 ms