Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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