Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms