Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms