Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms