Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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TRIM47Q96LD4 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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TRIM47Q96LD4 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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TRIM47Q96LD4 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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TRIM47Q96LD4 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM47Q96LD4 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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