Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms