Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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