Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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