Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SNTA1Q13424 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
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