Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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