Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms