Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EPHB4P54760 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms