Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRGP23470 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRGP23470 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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