Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms