Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ropn1Q9ESG2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1Q9ESG2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms