Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF7Q6Q0C0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF7Q6Q0C0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms