Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms