Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USPL1Q5W0Q7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms