Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf3Q3UYV8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms