Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS72Q15906 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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