Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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UBE4AQ14139 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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UBE4AQ14139 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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UBE4AQ14139 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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UBE4AQ14139 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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UBE4AQ14139 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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UBE4AQ14139 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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UBE4AQ14139 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE4AQ14139 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
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