Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpdl3bP58242 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms