Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms