Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms