Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UFL1O94874 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UFL1O94874 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFL1O94874 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFL1O94874 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFL1O94874 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFL1O94874 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFL1O94874 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UFL1O94874 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFL1O94874 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFL1O94874 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFL1O94874 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFL1O94874 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFL1O94874 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UFL1O94874 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UFL1O94874 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UFL1O94874 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UFL1O94874 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UFL1O94874 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UFL1O94874 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UFL1O94874 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UFL1O94874 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UFL1O94874 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UFL1O94874 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UFL1O94874 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UFL1O94874 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UFL1O94874 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UFL1O94874 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UFL1O94874 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UFL1O94874 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UFL1O94874 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UFL1O94874 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UFL1O94874 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UFL1O94874 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms