Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Skint4A7TZF3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skint4A7TZF3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms