Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MBD3L3A6NE82 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD3L3A6NE82 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms