Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pramef25A2ASI9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pramef25A2ASI9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pramef25A2ASI9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef25A2ASI9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms