Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CAPN6Q9Y6Q1 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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