Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCZQ96LD1 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms