Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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