Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms