Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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