Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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