Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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